В начале 21 века по официальной версии в Антарктиде падает метеорит. Это приводит к растоплению льдов и затоплению всех прибрежных территорий. Мир на время погружается в хаос, но потом начинает понемногу восстанавливаться. Это событие было названо «Второй удар».
Школьника Икари Синдзи вызывает к себе отец, являющийся главой могущественной организации NERV. Под давлением отца и обстоятельств Икари начинает пилотировать самое удивительное и разрушительное оружие людей — боевой робот Евангелион.
На Токио-3, где находится штаб квартира NERV, нападают странные существа, прозванные Ангелами. Однако, с течением времени Икари начинает узнавать всю правду о «Втором ударе», NERV и Ангелах. И его разум начинает медленно погружаться в пучины отчаяния.
1-я часть (Death - 1 час 13 минут) является пересказом (с несущественными изменениями и непринципиальными дополнительными сценами) событий первых 24-х эпизодов основного сериала.
2-я часть (Rebirth) — это незаконченная рабочая версия 1-ой части фильма Конец Евангелиона (1997).
Фильм показывался в кинотеатрах и по кабельным каналам и в процессе его часть Death несколько раз модифицировалась. Существует немалое количество легенд и недопонимания, связанных с фильмом. Одна из них такая, что уже после выхода Конец Евангелиона в Смерть и перерождение включили новую версию Rebirth, являющуюся улучшенной версией части оригинального фильма EoE. Это неверно. С момента выпуска EoE не менялся никак. А часть Death из Смерти и перерождения менялась только в худшую сторону.